第二代CR200J与上一代相比有诸多改进。首先，车体断面改为鼔型，车厢宽度和坐席与CR300和CR400系列相同，由3105 mm加宽至3360 mm，坐席宽度也将大幅度加宽，车辆间距缩短到800mm，风挡改为对波橄榄型双层折棚风挡，提高车体气密性，拖车空调机组原有一车两台的改为一台，车厢高度仍保持4433 mm，是目前国内最“胖”的单层列车，另外，虽然车体宽度增加，但整体重量控制相较于第一代更优。座位数及布局与CR200J第一代保持不变，但坐席宽度有所增加，且乘客使用的充电插座由坐席下部改为与CR300/400系列相同的位置，即二等座插座位于座椅接缝处下方，一等座位于中央扶手。
在安全性和舒适性等方面还有多项改进，拖车控制网络由LON网改为Ethernet以太网，网络控制系统提升互联、互通和互控功能，动力车、拖车、控制车故障报警信息互通，形成统一的列车监测信息网。通讯、重联连接器采用矩形连接器，同时所有连接器插接采用螺栓固定方式，DC600V使用2个矩形连接器，正负极分开。车门由电控气动改为电控电动塞拉门，取消低站台停靠功能，取消站台补偿器。
初期生产三组试验车，其中包括株洲+浦镇CR200J-2201（FXD1-J0201）、大连+唐山CR200J-1201（FXD3-J0201）、大同+四方CR200J-4201（FXD3-J8201）三组。
2020年04月11日，株洲厂首台FXD1J-0201动力车启程前往北京。
2020年04月19日，拖车抵达北京。
2020年05月18日，CR200J-2201（FXD1-J0201）抵达上海进行测试。
2020年05月22日，参与通沪铁路联调联试。
2020年06月06日，前往陕西进行测试。
2021年09月10日，中老铁路中方采购3组160 km/h动力集中动车组。
2021年10月16日，FXD1-J0202抵达南京浦镇，将作为量产车首台机车。
2021年11月02日，CR200J1-2049（FXD1-J0203）/2050（FXD1-J0204）交付太原局集团
2021年11月12日，2049/2050投入太原至吕梁至柳林运营（归还之前从昆明借用的2组）。
2021年11月中下旬，多组列车相继交付昆明局集团。
2021年12月03日，中老铁路（玉磨铁路）开通。2021年12月起在京哈线北京至沈阳段投入运营。2021年8月招标的其余列车在2021年12月全部交付。
2022年12月14日，CR200J1-B-2075（FXD1-J0228）/CR200J1-B-2081（FXD1-J0234）出厂交付昆明局集团。
2022年12月24日，CR200J1-B-2082（FXD1-J0235）/CR200J1-B-2083（FXD1-J0236）出厂交付西安局集团。
CR200J-2071（FXD1-J0201）为原样车2201。
技术上支持任意方向重联，但因为用户选配问题，动力车采用詹式车钩，两端车钩不一致，仅支持控制车-控制车重联，重联后动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
CR200J2-B型采用中车大同电力机车有限公司生产的动力车，机车型号为FXD1-J8000。拖车由中车青岛四方机车车辆股份有限公司或中车长春轨道客车股份有限公司生产。
2020年06月09日，中车四方厂CR200J-4201（大同厂FXD1-J8201）曝光。
2020年07月11日，CR200J-4201（FXD1-J8201）抵达北京进行测试。
2021年06月01日，首组量产版CR200J(2.0版)的CR200J2-JT001（FXD1-J8202）下线交付金温铁路公司。
2021年06月04日，CR200J2-JT001出厂并于2021年06月07日抵达金温公司，随后在金台铁路进行测试。
2021年06月09日，CR200J2-JT002（FXD1-J8203）出厂，并于06月12日抵达。
2021年06月25日，金台铁路开通运行，CR200J2投入运营，台州西(金台场)~永康南(普速场)开行D5472/D5471、D5474/D5473、D5476/D5475次3对、永康南(普速场)~头门港开行D5477/D5478次1对（CR200J2-JT001/002）。
CR200J-4006（FXD1-J8201）为原样车4201。
技术上支持任意方向重联，但因为用户选配问题，动力车采用詹式车钩，两端车钩不一致，仅支持控制车-控制车重联，重联后动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
2020年04月07日，大连厂首台FXD3J-0201动力车启程前往北京。
2020年04月19日，拖车抵达北京。
2020年05月21日，CR200J3-1201（FXD3-J0201）抵达上海进行测试。
2020年05月22日，参与通沪铁路联调联试。
2020年06月06日，前往陕西进行测试。
2021年09月03日，CR200J投入陕西城际铁路运营。
2021年11月04日，首批量产车CR200J3-1055/1056交付济南局集团，2021年11月06日，CR200J3-1057/1058交付济南局集团，并于2021年11月12日投入运行。
2021年11月23日/27日，先后共4组（CR200J3-1069/70、1071/72）交付成都局集团。
2021年12月起在京哈线北京至沈阳段投入运营。
2021年招标的其余列车在2021年12月全部交付。
2022年12月20日，交付哈尔滨集团，并于26日在佳鹤、哈佳线投入运营。
主要包括京哈线（北京-沈阳）、峨广线、包西线（西安-延安）、集包线、包兰线（包头-临河）、呼鄂线、西康线、达成线、襄渝线（达州-重庆）、佳鹤线、哈佳线等。
CR200J-1049（FXD3-J0201）为原样车1201。
FXD3-J0666为永磁电机实验车，仅制造1台动力车（截至2024年01月），该车于2023年07月在铁科院环形铁道进行试验，08月前往陕西境内陇海铁路西宝、宝天段试验，09月前往银西高铁进行试验。
技术上支持任意方向重联，但因为用户选配问题，动力车采用詹式车钩，两端车钩不一致，仅支持控制车-控制车重联，重联后动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
CR200J1-B采用鼓形车身，车身加宽，同时编组调整，另有多项改进，且取消低站台停靠功能。列车设计编组20辆，2M18T，但样车未制造整组，仅制造5节样车进行试验，2021年03月07日，浦镇制造的4节列车，包括高级软卧车WG990105、一等卧WY990106、二等卧WE990107、二等座餐车ZEC990108抵达北京进行测试。
长编组实验车无配套的动力车，实验时暂与短编组动力车FXD1-J0201、FXD3-J0201共同测试，还有部分其他座位车混编入实验编组，实验时的编组为FXD1-J0201 / WE990107 / WY990106 / WG990105 / ZEC990108 / ZE220106 / ZE220105 / ZE220103 / ZE220102 / ZE220101 / ZE120106 / ZE120105 / ZE120103 / ZE120102 / ZE120101 / ZEC990104 / WG990101 / WY990102 / WE990103 / FXD3-J0201，后续又制造了一节布局不同的WG990110但未参与测试。列车未投入运营，WY、WE和ZEC车的车体均改造为CR200J1-C，WG封存。
长编组动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
CR200J3-B采用鼓形车身，车身加宽，同时编组调整，另有多项改进，且取消低站台停靠功能。列车设计编组20辆，2M18T，但样车未制造整组，仅制造5节样车进行试验，2021年03月07日，唐山制造的4节列车，包括高级软卧车WG990101、一等卧WY990102、二等卧WE990103、二等座餐车ZEC990104抵达北京进行测试。
长编组实验车无配套的动力车，实验时暂与短编组动力车FXD1-J0201、FXD3-J0201共同测试，还有部分其他座位车混编入实验编组，实验时的编组位FXD1-J0201 / WE990107 / WY990106 / WG990105 / ZEC990108 / ZE220106 / ZE220105 / ZE220103 / ZE220102 / ZE220101 / ZE120106 / ZE120105 / ZE120103 / ZE120102 / ZE120101 / ZEC990104 / WG990101 / WY990102 / WE990103 / FXD3-J0201，后续又制造了一节布局不同的WG990109但未参与测试。列车未投入运营，WY、WE和ZEC车的车体均改造为CR200J3-C，WG车目前作为测试车用于新技术和新部件的测试。
长编组动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
CR200JS-G型“高原双源动力集中动车组”是复兴号动车组家族的一员，专为拉萨至林芝、拉萨至日喀则设计的一款能够满足高原气候条件运行的混合动力动力集中动车组。动力车基于技术相对成熟的HXD1D和FXN3，针对高原环境进行优化，同时，能够实现内电互控，车厢提供供氧设施，能够适应高原地区的线路环境，可以在最高5100 m海拔运行。电力动力车基于成熟的HXD1D，电机型号YQ-1224-4，总功率7200 kW，内燃动力车基于FXN3，配备两台12V265柴油机，采用中车大连电力牵引研发中心研制的8GCD-02100000 IGBT-VVVF，装机功率2×3500 kW，额定功率2×3250 kW，轴式2×(A1A-A1A)，轮周牵引功率2×2700 kW。
列车设计为灵活编组，但由于其特殊构造，不支持重联运行。列车编组最大15辆，拖车最大12辆，投入运行的列车编组12辆，动力车3辆，拖车9辆，其中二等座车6辆，二等座/餐车1辆，一等座车1辆，一等/商务座车1辆，定员755人，其中二等座629，一等座120，商务座6。由于增加了供氧设施，二等座车相较普通版本减少一排座椅，座位数由98变为93，除商务座外，其余坐席不支持旋转方向。
2021年03月12日，首组内燃动力车亮相。
2021年03月15日，首台电力动力车亮相。
2021年03月22日，首组拖车亮相并启程前往大连，与两组动力车共同进行实验。
首组车为特殊编组。HXD1D-J0001 + ZE290107 + ZE290106 + ZE290105 + ZY290108 + ZEC290104 + ZE290103 + ZE290102 + ZE290206 + ZE290205 + ZE290202 + ZE290201 + ZE290101 + FXN3-J0001B + FXN3-J0001A。首组车实验过程中动力车拆除了部分制动盘，电力动力车拆除两对，内燃动力车拆除三对，模拟更加恶劣的线路环境，测试车辆能否在严苛的环境中稳定运行。
2021年03月23日，第二组电力动力车抵达北京进行试验。
2021年04月04日，第二组内燃动力车抵达北京进行试验。
2021年04月27日，结束在大连试验的特殊编组首组车启程前往西安。
2021年04月29日，首组车抵达西安。
2021年05月04日至09日，首组车在陇海铁路宝天段进行试验。
2021年05月05日，首辆一等/商务车亮相。
2021年05月11日，首组车经青藏铁路驶入西藏。
2021年05月26日，第三组车完整编组在株洲进行测试。
2021年06月08日，第二组动力车与前两组车剩余的六节拖车与第三组完整编组先后启程前往拉萨。
2021年06月25日，投入运营，开通拉萨至林芝D8981/4次，林芝-日喀则D8982/3、D8992/3次，拉萨至日喀则D8991/4。
2021年10月11日起，拉萨-林芝D8981次改为C881次，林芝-日喀则D8982/8983次改为C882/883次，日喀则-拉萨D8994次改为C894次，拉萨-日喀则D8991次改为C891次，日喀则-林芝D8992/8993次改为C892/893次，林芝-拉萨D8984次改为C884次，拉萨-林芝高峰线D9901/9902次改为C921/922次，同时增开拉萨-日喀则高峰线C923/924次。
中老铁路CR200J型采用中车大连机车车辆有限公司生产的动力车，机车型号为FXD3-J，拖车由中车青岛四方机车车辆股份有限公司生产，2021年10月13日该车命名为“澜沧号”。首批两组列车坐席布置与国内相同，第三组列车设置商务座并增加一等座数量，第四组列车改为新款商务座并调整了编组顺序。
2020年04月07日，新建铁路磨丁至万象线动车组采购项目开始招标，采购2组160 km/h动力集中动车组，后又追加1组。
2020年09月26日，中老铁路动车组项目合同在北京签署（大连+四方中标，型号为CR200J3）。
2021年05月12日，中老铁路动车组大连动力车回送青岛与四方拖车编组并进行测试。
2021年10月09日，首组列车发货。
2021年10月16日11时（老挝时间10时）首组列车抵达老挝万象。
2021年12月03日，投入运营（2组）。
2022年03月21日，第三台动力车FXD3J-7003由大连厂发货至青岛进行总装。
2022年03月30日，第三组列车交付。
2023年09月15日，第四组列车交付。
2023年09月29日，第四组列车上线运营。
技术上支持任意方向重联，但因为用户选配问题，动力车采用詹式车钩，两端车钩不一致，仅支持控制车-控制车重联，重联后动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
CR200J3型采用中车大连机车车辆有限公司生产的动力车，机车型号为FXD3-J，拖车由中车青岛四方机车车辆股份有限公司生产，此种搭配比较少见。涂装与其他不同，增加了红色线条，车内增加老挝文标识。
2021年10月10日，机车在中车大连机车车辆有限公司下线并回送至青岛进行总装。
2021年10月31日，CR200J3-4004（FXD3-J0207）、4005（FXD3-J0208）两组列车出厂，并于2021年11月04日抵达昆明。
2021年12月03日，正式投入运营。
中老铁路（玉磨铁路）。2023年4月起，因老挝境内列车数量不足，除担当跨境列车之外，还担当部分老挝国内车次的运营。
技术上支持任意方向重联，但因为用户选配问题，动力车采用詹式车钩，两端车钩不一致，仅支持控制车-控制车重联，重联后动力车在两端，受电弓间距不能适应不同双断口分相的无电区及中性区长度，超出大部分新建客运专线的要求，因此不能在大部分新建客运专线运行。
马来西亚东海岸铁路线路客运原计划使用11组6节编组动力分散动车组，但由于价格较高，同时该线路站距较大对列车启停性能要求不高，使用更加经济的动力集中动车组则是更好的选择。由中车浦镇制造的拖车已于2024年3月开工，按照相关文件，列车仍为6节编组，动力车规格则保持一致。其他具体细节目前尚不清楚，参数仅供参考。
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