相较CR200J1-B，CR200J1-C对坐席布局进行优化，座椅间距加大，全部座椅改为可旋转，增设有6个与CR400AF-Z款式相同的商务座，全车定员优化减少至676人，餐车采用与CR400系列类似的设计，同时加设空调压力保护装置，优化车窗设计，提升隧道运行和会车时的舒适度，采用全新涂装，相对原涂装更加清爽。

采用更先进的列车网络，动力车采用以太网控车技术，动力车的控制网络采用以太网和MVB网双网冗余控制，实现了双网热备，和既有型号一样可以实现不同制造商、不同型号的动力车、拖车、控制车互联互通互控动拖车。列车拥有智能化诊断技术，动力车有完整的故障诊断智能化系统，对全列关键系统及部件进行状态监测，在车载状态显示界面进行显示并同步回传至地面，指导和协助列车操作与故障诊断与处置。2023-2024年制造的部分列车采用微机控制制动，将制动信号通过列车网络进行传递，并可自动计算每节车厢所需的制动力，能够实现更优的制动效果。2025年制造的列车优化了车体何车窗结构，将原有F8电空制动装置升级为EPC微机电空制动装置。

首批列车于2023年10月投入运行。

整车的网络控制系统采用列车级网络（Ethernet Train Backbone, ETB）+车辆级网络（Ethernet Consist Network, ECN），列车级网络使用ETB贯穿全列，车辆级使用ECN星形连接各子系统设备，ETB网络和ECN网络带宽均达到100 Mbps。动力车控制车和餐吧车分别设置列车级以太网网关（ETHGW），形成3个编组节点，除餐吧车以外的拖车设置以太网中继器（Ethernet Repeater, EREP）用于放大信号，保证ETB总线数据长距离传输。每节车设置两个车辆级以太网交换机，形成双通道冗余结构，子系统采用基于TRDP协议的双网口冗余设计，每个网口连接到对应的网络通道中，其中重要子系统设备冗余。拖车增加制动控制单元，通过ETB实现与动力车/控制车的数据交互；将车电系统及行车安全系统整合为监控平台。所有与地面进行通信的设备均设置网络防火墙，以保证网络安全。网络控制系统采用动力车、拖车、控制车以太网一体化设计，统一了网络通信标准，实现快速组网，可以满足动力集中项目中动车拖车灵活编组的需求。