第二代CR200J与上一代相比有诸多改进。首先，车体断面改为鼔型，车厢宽度和坐席与CR300和CR400系列相同，由3105 mm加宽至3360 mm，坐席宽度也将大幅度加宽，车辆间距缩短到800mm，风挡改为对波橄榄型双层折棚风挡，提高车体气密性，拖车空调机组原有一车两台的改为一台，车厢高度仍保持4433 mm，是目前国内最“胖”的单层列车，另外，虽然车体宽度增加，但整体重量控制相较于第一代更优。座位数及布局与CR200J第一代保持不变，但坐席宽度有所增加，且乘客使用的充电插座由坐席下部改为与CR300/400系列相同的位置，即二等座插座位于座椅接缝处下方，一等座位于中央扶手。

在安全性和舒适性等方面还有多项改进，拖车控制网络由LON网改为Ethernet以太网，网络控制系统提升互联、互通和互控功能，动力车、拖车、控制车故障报警信息互通，形成统一的列车监测信息网。通讯、重联连接器采用矩形连接器，同时所有连接器插接采用螺栓固定方式，DC600V使用2个矩形连接器，正负极分开。车门由电控气动改为电控电动塞拉门，取消低站台停靠功能，取消站台补偿器。

CR200J(2.0)系列所有型号

　CR200J3-B

2020年04月问世

2022年12月24日更新

初期生产三组试验车，其中包括株洲+浦镇CR200J-2201（FXD1-J0201）、大连+唐山CR200J-1201（FXD3-J0201）、大同+四方CR200J-4201（FXD3-J8201）三组。

2020年04月07日，大连厂首台FXD3J-0201动力车启程前往北京。

2020年04月19日，拖车抵达北京。

2020年05月21日，CR200J3-1201（FXD3-J0201）抵达上海进行测试。

2020年05月22日，参与通沪铁路联调联试。

2020年06月06日，前往陕西进行测试。

2021年09月03日，CR200J投入陕西城际铁路运营。

2021年11月04日，首批量产车CR200J3-1055/1056交付济南局集团，2021年11月06日，CR200J3-1057/1058交付济南局集团，并于2021年11月12日投入运行。

2021年11月23日/27日，先后共4组（CR200J3-1069/70、1071/72）交付成都局集团。

2021年12月起在京哈线北京至沈阳段投入运营。

2021年招标的其余列车在2021年12月全部交付。

2022年12月20日，交付哈尔滨集团，并于26日在佳鹤、哈佳线投入运营。

主要包括京哈线（北京-沈阳）、峨广线、包西线（西安-延安）、集包线、包兰线（包头-临河）、呼鄂线、西康线、达成线、襄渝线（达州-重庆）、佳鹤线、哈佳线等。

CR200J-1049（FXD3-J0201）为原样车1201。